Modifica dell'indicazione del nome

Circa un anno fa abbiamo ricevuto una comunicazione dal Consolato d'Italia in Zurigo relativa ad una richiesta di indicazione del nome ai sensi dell'art.36 del dpr 396/2000 relativa ad un cittadino residente all'AIRE del nostro comune. La suddetta comunicazione veniva inviata all'ufficiale dello stato civile di un altro comune che ha trascritto l'atto di nascita ed al nostro comune per conoscenza e contiene la richiesta sottoscritta dal cittadino di volere essere indicato con tre nomi invece di uno come in precedenza. Dopo pochi giorni è arrivata la comunicazione del comune di trascrizione dell'atto di nascita relativa all'apposizione dell´annotazione (formula 164 bis) nell'atto di nascita dell'interessato. A seguito di ciò abbiamo provveduto ad emettere un provvedimento anagrafico di rettifica delle generalità del soggetto indicandolo con tre nomi invece del solo primo nome, con conseguente modifica del codice fiscale.
Oggi il cittadino si presenta presso la nostra anagrafe dichiarando che non sapeva cosa comportava la richiesta sottoscritta presso il Consolato, che non vuole essere indicato con tre nomi ma vuole chiamarsi con un solo nome come sempre fatto e riavere attribuito il codice fiscale precedente.
Come ci dobbiamo comportare?